RNA

IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Kit

Cat.No 용량 주문수량 판매가
17491 50 col. up down 300,000원
PRODUCT INFORMATION
Description

화본과 및 콩과식물종자를 포함하여 다양한 잎, 줄기, 뿌리, 그리고 씨앗과 같은 Plant 시료로부터 total RNA를 추출할 수 있는
2 Column Spin type의 제품

  • • 다양한 식물 시료로부터 total RNA 추출 가능
     - 다량의 대사산물을 포함하는 종자 시료로부터 total RNA 추출에 효과적
     - 화본과 및 콩과식물로부터 total RNA 추출에 효과적
  • • 고순도 및 고수율의 RNA 추출 가능
     - 2 column system으로 신속하게 gDNA를 제거하고 단시간(20분) 내에 RNA 추출이 가능
     - 별도의 DNase 처리 없이 gDNA를 99% 이상 제거
  • • Non-phenol 방식으로 RNA 추출

IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit는 다양한 식물 종들의 잎, 줄기, 뿌리, 그리고 씨앗과 같은 조직 시료로부터 total RNA를 추출할 수 있도록
개발된 최적의 제품입니다.

식물체의 경우 광합성을 통해 다양한 대사산물을 축적하며 이러한 산물들은 핵산 추출의 inhibitor로 작용하는데, 이러한 inhibitor를 제거하기 위하여 lysis 단계에서 phenol 또는 Phenol을 사용하지 않는 경우는 고농도의 chaotropic salt를 사용하여 시료의 lysis 단계에서 함께 제거해 주고 있습니다.
이러한 경우 벼, 보리, 밀 등과 같은 화본과 종자(다량의 전분 함유) 혹은 콩, 녹두, 완두 등과 같은 콩과 종자(다량의 단백질과 지질을 함유)의 경우 binding을 위하여
알콜을 혼합하게 되면 매우 많은 양의 침전이 발생하게 되며 이때 추출하고자 하는 핵산마저도 함께 침전(Co-precipitation)되어 최종 회수 분획 내
RNA의 함량이 극히 낮게 되는 단점을 가지게 되는데 IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit가 그러한 단점을 보완한 제품이라 할 수 있습니다.

IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit는 식물의 대사 산물이 많은 부분의 효과적인 total RNA 추출을 위하여 Lysis 과정 중 chaotropic salt를
사용하지 않으므로 lysis 단계에서 inhibitor까지 용출되어 실험에 저해를 미치는 요인이 없이 높은 수율 및 순도의 RNA를 추출 할 수 있습니다.
또한 Sieve Spin Column을 사용하여 homogenate 내의 상청액을 빠르게 회수하도록 되어 있으며 gDNA 오염을 최소화하기 위하여 gDNA binding column을
사용하는 2 column system을 적용하여 gDNA의 제거가 가능하도록 설계된 제품입니다.

앞서 언급한 바와 같이, enzymatic Lysis가 없어 20분 이내에 다양한 Plant 시료로부터 빠르고 간편하게 RNA를 추출할 수 있으며 조직과 종별로 구분되어 있는
두 가지의 protocol을 제공하여 고순도 고효율의 total RNA를 하나의 Kit로 추출하실 수 있습니다.                                        
IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit의 모든 제품은 pathogen research가 효과적으로 수행될 수 있도록 column을 개별 포장하는
CAPS 공법을 이용하여 contamination에 대한 우려를 현저히 줄였습니다. (그림 2. 참조)
따라서, IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit를 통하여 추출된 RNA는 pathogen research뿐만 아니라 Microarray 등에 적용 가능합니다.                                        

그림 2. Spin Column & CAPS Information

Applications
  • 01Plant pathogen detection
  • 02RT-PCR and real-time RT-PCR
  • 03Microarray
  • 04Northern Blotting
  • 05Infectious disease research
  • 06cDNA synthesis
Kit Contents
Contents 50 COLUMNS
Buffer RLE 25ml × 1 ea
Buffer RB 20ml × 1 ea
Buffer RLD 15ml × 1 ea
Buffer RPB 15ml × 1 ea
Buffer RW1 40ml × 1 ea
Buffer RW2 (concentrate) 10ml × 1 ea
Buffer RE 20ml × 1 ea
Sieve Spin Columns 50 Columns
gDNA Remover Spin Columns 50 Columns
Binding Columns (Red O-ring) 50 Columns
Collection Tubes (2.0 ml tubes) 50 tube
Technical Data

다양한 식물 종으로부터의 total RNA 회수율

IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit를 이용하여 다양한 식물 종들의 여러 조직으로부터 total RNA를 추출/정제하여
순도와 농도를 확인하였습니다. 이차 대사물로 인하여 추출이 어려운 종들에서도 고효율의 total RNA를 추출할 수 있으며,
대사산물이 많은 종자 시료로부터도 고순도의 total RNA를 정제함을 볼 수 있습니다.

추출된 RNA의 Quality 분석

IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit를 비롯하여 phenol 방식의 RNA 추출 Kit, 타사 동일 기능의 RNA 추출 제품을 이용하여 total RNA를 추출한 후 Agilent® 2100 bioanalyzer로 추출된 각각의 RNA quality를 분석한 결과,
IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit를 이용하여 추출된 RNA가 Microarray 분석에 용이한 수준의 고수율, 고순도의 RNA임을 확인 할 수 있었습니다.

Lane M, RNA Ladder Marker; lane C, Positive control; lane 1, Leaf RNA extraction using easy-spin™ IIp Kit(Cat. No. 17310, iNtRON); lane 2, Leaf RNA extraction using Competitor’ kit; lane 3, Leaf RNA extraction using IQeasy™ plus Plant Mini Kit; lane 4, Seed RNA extraction using Competitor’ kit; lane 5, Seed RNA extraction using IQeasy™ plus Plant Mini Kit

Real time PCR을 통한 정량 분석 결과

IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit을 이용하여 추출된 total RNA를 1/10 serial dilution 한 후 ONE-STEP RT-PCR PreMix Kit(iNtRON, Cat. No. 25101)로 RT 후 GAPDH Gene에 대한 정량 Test를 통하여 추출효율을 본 결과입니다.
결과에서 볼 수 있듯이 고순도의 RNA로 Real-time RT-PCR에 용이함을 알 수 있습니다.

TroubleShooting Guide
QProtocol 상에 sample volume이 25~100mg으로 되어 있는데 얼마 정도의 양이 가장 적당합니까?
A콩 종자를 대상으로 최적사용량을 확인한 결과 50mg에서 적정 샘플 사용량이 확인되었습니다.
이는 샘플에 따라 약간의 차이는 있을 수 있기에 25~100mg으로 기재한 것이며, 100mg을 넘지 않도록 주의하시기 바랍니다.
Q쌀에서 RNA를 추출하였는데 결과가 나오지 않았습니다. 이유는 무엇입니까?
A"Protocol A"는 plant leaf 혹은 Solanaceae, Cucurbitaceae 같은 seed의 최적 protocol입니다.
Gramineae를 포함한 Fabaceae, Brassicaceae seed는 “Protocol B”로 진행하시기 바랍니다.
QQ사의 plant RNA 추출 키트를 사용 중인데 지인을 통해 인트론의 iQeasy plus Plant RNA 제품을 소개받았습니다.
이 제품의 특징은 무엇인가요?
A우선 iQeasy Plus Plant RNA Extraction kit는 Phenol과 같은 유기용제를 사용하지 않으며 DNaseI과 같은 별도의 효소처리를
하지 않아도 되는 Column System 방식으로 신속하게 RNA 추출이 가능합니다.
또한 Contamination의 차단을 위해 Column 개별 포장(CAPS)이 적용된 제품입니다.
Q프로토콜을 보면 샘플 준비 단계에서 액체질소를 이용하여 막자사발로 갈아서 사용하라고 적혀있는데,
샘플을 분쇄하지 않고 생 시료를 잘게 썰어 RLE buffer를 넣어 실험 진행하여도 될까요?
A액체질소 외에도 샘플을 분쇄할 수 있는 pestle 혹은 homogenizer를 사용하여도 무방합니다.
QFungi에서 RNA 추출을 하고 싶은데 solution 방식이 아닌 spin 방식의 제품을 찾고 있는데 어떤 제품을 사용해야 될까요?
A당사의 Fungi RNA 추출 제품으로 spin 방식의 제품은 없습니다.
전처리 과정을 거쳐 IQeasy plus plant 제품의 적용이 가능할 것으로 보입니다.
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