IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Kit
화본과 및 콩과식물종자를 포함하여 다양한 잎, 줄기, 뿌리, 그리고 씨앗과 같은 Plant 시료로부터 total RNA를 추출할 수 있는
2 Column Spin type의 제품
IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit는 다양한 식물 종들의 잎, 줄기, 뿌리, 그리고 씨앗과 같은 조직 시료로부터 total RNA를 추출할 수 있도록
개발된 최적의 제품입니다.
식물체의 경우 광합성을 통해 다양한 대사산물을 축적하며 이러한 산물들은
핵산 추출의 inhibitor로 작용하는데, 이러한 inhibitor를 제거하기 위하여 lysis 단계에서 phenol 또는 Phenol을 사용하지 않는 경우는 고농도의 chaotropic salt를 사용하여 시료의 lysis 단계에서 함께 제거해 주고 있습니다.
이러한 경우 벼, 보리, 밀 등과 같은
화본과 종자(다량의 전분 함유) 혹은 콩, 녹두, 완두 등과 같은 콩과 종자(다량의 단백질과 지질을 함유)의 경우 binding을 위하여
알콜을 혼합하게 되면 매우 많은 양의 침전이 발생하게 되며 이때 추출하고자 하는 핵산마저도 함께 침전(Co-precipitation)되어 최종 회수 분획 내
RNA의 함량이 극히 낮게 되는 단점을 가지게 되는데 IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit가 그러한 단점을 보완한 제품이라 할 수 있습니다.
IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit는 식물의 대사 산물이 많은 부분의 효과적인 total RNA 추출을 위하여 Lysis 과정 중 chaotropic salt를
사용하지 않으므로 lysis 단계에서 inhibitor까지 용출되어 실험에 저해를 미치는 요인이 없이 높은 수율 및 순도의 RNA를 추출 할 수 있습니다.
또한 Sieve Spin Column을 사용하여 homogenate 내의 상청액을 빠르게 회수하도록 되어 있으며 gDNA 오염을 최소화하기 위하여 gDNA binding column을
사용하는 2 column system을 적용하여 gDNA의 제거가 가능하도록 설계된 제품입니다.
앞서 언급한 바와 같이, enzymatic Lysis가 없어 20분 이내에 다양한 Plant 시료로부터 빠르고 간편하게 RNA를 추출할 수 있으며 조직과 종별로 구분되어 있는
두 가지의 protocol을 제공하여 고순도 고효율의 total RNA를 하나의 Kit로 추출하실 수 있습니다.
IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit의 모든 제품은 pathogen research가 효과적으로 수행될 수 있도록 column을 개별 포장하는
CAPS 공법을 이용하여 contamination에 대한 우려를 현저히 줄였습니다. (그림 2. 참조)
따라서, IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit를 통하여 추출된 RNA는 pathogen research뿐만 아니라 Microarray 등에 적용 가능합니다.
그림 2. Spin Column & CAPS Information
Contents | 50 COLUMNS |
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Buffer RLE | 25ml × 1 ea |
Buffer RB | 20ml × 1 ea |
Buffer RLD | 15ml × 1 ea |
Buffer RPB | 15ml × 1 ea |
Buffer RW1 | 40ml × 1 ea |
Buffer RW2 (concentrate) | 10ml × 1 ea |
Buffer RE | 20ml × 1 ea |
Sieve Spin Columns | 50 Columns |
gDNA Remover Spin Columns | 50 Columns |
Binding Columns (Red O-ring) | 50 Columns |
Collection Tubes (2.0 ml tubes) | 50 tube |
다양한 식물 종으로부터의 total RNA 회수율
IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit를 이용하여 다양한 식물 종들의 여러 조직으로부터 total RNA를 추출/정제하여
순도와 농도를 확인하였습니다. 이차 대사물로 인하여 추출이 어려운 종들에서도 고효율의 total RNA를 추출할 수 있으며,
대사산물이 많은 종자 시료로부터도 고순도의 total RNA를 정제함을 볼 수 있습니다.
추출된 RNA의 Quality 분석
IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit를 비롯하여 phenol 방식의 RNA 추출 Kit, 타사 동일 기능의 RNA 추출 제품을 이용하여 total RNA를 추출한 후 Agilent® 2100 bioanalyzer로 추출된 각각의 RNA quality를 분석한 결과,
IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit를 이용하여 추출된 RNA가 Microarray 분석에 용이한 수준의 고수율, 고순도의 RNA임을 확인 할 수 있었습니다.
Lane M, RNA Ladder Marker; lane C, Positive control; lane 1, Leaf RNA extraction using easy-spin™ IIp Kit(Cat. No. 17310, iNtRON); lane 2, Leaf RNA extraction using Competitor’ kit; lane 3, Leaf RNA extraction using IQeasy™ plus Plant Mini Kit; lane 4, Seed RNA extraction using Competitor’ kit; lane 5, Seed RNA extraction using IQeasy™ plus Plant Mini Kit
Real time PCR을 통한 정량 분석 결과
IQeasy™ plus Plant RNA Extraction Mini Kit을 이용하여 추출된 total RNA를 1/10 serial dilution 한 후 ONE-STEP RT-PCR PreMix Kit(iNtRON, Cat. No. 25101)로 RT 후 GAPDH Gene에 대한 정량 Test를 통하여 추출효율을 본 결과입니다.
결과에서 볼 수 있듯이 고순도의 RNA로 Real-time RT-PCR에 용이함을 알 수 있습니다.
상품명 | Cat.No | 용량 | 가격 | ||||
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Power cDNA Synthesis Kit |
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ONE-STEP RT-PCR PreMix Kit |
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RNase WiPER™ |
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