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DNA

G-DEX™ IIc Genomic DNA Extraction Kit (for Cell/Tissue)

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17231 300 tests up down 240,000원
PRODUCT INFORMATION
Description

Cell, Tissue 및 Bacteria로부터 다양한 sample starting amount에 따라 간편하게 Genomic DNA를 추출할 수 있는Solution type의 제품

  • • Cell, Tissue 및 Bacteria 등 다양한 Sample에서 추출 가능
  • • Sample Starting Amount에 따른 최적 Buffer 사용량 제시를 통한 고수율 및 고순도의 DNA 추출 가능
  •    - (1) 1x108 cell - 1mg
       - (2) 1 g tissue – 1 mg
       - (3) 1 ml Bacteria – 50 ug
       - (4) OD260:280 = 1.9 ~ 2.1
  • • 재현성 높은 DNA 추출 가능
  • • 최소 20분에서 최대 60분내에 4단계로 간편하게 DNA 추출 가능

G-DEX™ IIc Genomic DNA Extraction Kit(for Cell/Tissue)는 cell, tissue 및 bacteria로부터 간편하게 genomic DNA를 추출 할 수 있는 제품으로서,
spin type의 제품에 비해 sample starting amount에 의존하지 않고 small amount에서부터 maxi amount까지 다양한 범주에서 추출 가능하도록 고안된 solution type의 제품입니다. Sample starting amount에 따른 buffer 사용량을 제시하고 있으며 이는 최적 사용량에 따른 고수율 및 고순도의 genomic DNA를 재현성 높게
추출 할 수 있습니다.

본 Kit를 이용하여 genomic DNA를 추출 할 시, lysis, protein 제거, DNA pellet 수확 및 DNA hydration의 4단계의 protocol로 구성되어 있어 매우 간편하게 사용될 수 있도록 하였으며 Cell Lysis Buffer는 다양한 샘플의 세포 핵을 가장 효율적으로 lysis 시킬 수 있도록 개발되었고 PPT Buffer 의 경우, 별도의 가열처리 없이 단백질을 precipitation 시킬 수 있도록 하였습니다. 이는 최근 유전체 연구에 있어 genomic DNA 추출제품의 선택 시 고려 대상이 되는 것과 부합되는 사항으로, 고수율 및 고순도의 기준에 적합하며 이에 더하여 간편함(convenience)을 추가로 제공하고 있다고 할 수 있습니다.

본 제품을 이용하여 추출된 genomic DNA는 오염물질이 없는 깨끗한 DNA로 PCR이 자유로울 뿐만 아니라 Intact genomic DNA로 Southern blot에 효율적이며, cDNA chip시에 probe로 사용될 고순도 DNA라 할 수 있습니다.

Applications
  • 01PCR & Real-time PCR
  • 02Southern blotting
  • 03SNP
  • 04Gene cloning
  • 05Genotyping
  • 06Pathogen research etc.
Kit Contents
Contents 300 Tests
Lysis Buffer 60ml × 1 ea
PPT Buffer 25ml × 1 ea
DNA Rehydration Buffer 25ml × 1 ea
RNase A (Lyophilized powder) 3mg × 1 tube
Manual 1 ea
Technical Data

Cell Number 에 따른 영향 관찰

G-DEX™ IIc Genomic DNA Extraction Kit(for Cell/Tissue)를 이용하여 cell Number에 따른 genomic DNA 추출한 결과, 타사 제품 대비 cell Number에 따른 수율 및 순도에서 전체적으로 높게 나오는 것을 확인 하였습니다.

Cell Number(K562 cell) : 1X105, 5X105, 1X106, 5X106
iNtRON; Supplier A, Competitor A; Supplier B, Competitor B

TroubleShooting Guide
QTissue 적용 시 protocol은 없는지요? 제품 protocol은 cell에 대한 protocol만 있습니다.
ATissue 적용 시 10mg 당 Lysis buffer 150~200ul 첨가 후 Homogenization을 진행합니다. 이후 step은 cell protocol과 동일하게
진행하시면 됩니다.
Q현재 한우유전자검사용으로 P사 제품을 사용하고 있습니다. 이 제품으로 대체하여 사용 가능합니까?
A네. 사용 가능합니다. 당사 제품 구성 역시 Cell lysis, Protein PPT, DNA Rehydration buffer 등으로 구성되어 있어 별다른 protocol의
변경 없이 적용하여 사용 하실 수 있습니다.
Q150mm culture dish에서 culture를 하고 있습니다. 이 제품으로 150mm culture dish의 cell에서 한꺼번에 DNA 추출이 가능합니까?
A추출 가능합니다. 본 제품 프로토콜에는 초기 cell number에 따라 권장하는 buffer양을 표1에 정리하였습니다. 150mm dish의 경우 약 2x107 cell (Confluency) 정도되어 초기 Lysis buffer 3ml로 시작하시면 됩니다. 시작하시기 전에 cell 수를 측정하시어 확인 후 진행하시기를 바랍니다.
Qcell pellet이 lysis buffer 첨가 후 풀리지 않고 떠다닙니다. 그냥 진행하였는데 Yield가 매우 낮았습니다. 이에 대한 원인이 무엇이며,
해결책은 무엇입니까?
A최초 배양액 혹은 PBS 내 cell을 원심분리하여 cell pellet을 얻습니다. 이렇게 얻어진 cell pellet에 바로 lysis buffer를 첨가할 시 cell clump가 풀리지 않고 떠다니게 되며, 결과적으로 Yield가 떨지는 요인이 됩니다. 이에 대한 해결방법으로 cell pelleting 이후 상층액을 제거할 시 약간의 media를 남겨놓습니다. 남겨진 media는 cell pellet의 resuspend를 위함이기 때문에 양은 중요치 않습니다. 이를 vortexing 혹은 tapping을 통해 cell pellet이 완전히 resuspend되도록 합니다. 뭉쳐진 cell이 없는 것을 확인한 후 Lysis buffer를 첨가하여 이후 protocol을 수행합니다.
Q제품 내 포함된 RNase A solution이 부족한데 실험실에서 보유하고 있는 다른 제품을 사용하여도 됩니까?
A제품 내 RNase A solution은 ( 1~2x106 + Lysis buffer 150ul ) 진행 시 1ul를 첨가하도록 300ul 용량으로 공급해 드리고 있습니다.
이는 정량 사용 시 부족하지 않은 양입니다. 하지만 선생님께서 특별한 사유로 RNase A 첨가량을 늘리고 싶으실 경우에는 같은 농도로
추가하여 사용하시면 됩니다. 이 제품의 RNase A 농도 4mg/ml입니다.
QDNA pellet에 Rehyd. buffer 첨가 후 pellet이 잘 녹지 않습니다.
ADNA 농도가 높을 경우 pellet 이 잘 녹지 않을 수 있습니다. 이때 Rehyd. buffer를 1.5~ 3배 정도 더 넣어주시면 됩니다. 이때 농도를 계산하여 첨가하도록 합니다. 또한 65℃에서 30~60분간 incubation 하면 pellet을 녹이는데 도움이 됩니다. 4℃에서 over night하여도 됩니다.
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